河南省種子協會是黨和政府領導下的全省從事農作物種子生產、經營、管理、科研、教學等單位和社會團體以及種子行業的專家、學者、從業人員、農民育種家、技術推廣人員自愿參加組成的全省跨部門跨行業社團組織，是黨和政府聯系種子工作者的紐帶和橋梁，是發展我省農作物種子科技事業的參謀和助手。
河南省種子協會的宗旨是以經濟建設為中心，堅持四項基本原則，遵守國家憲法、法律、法規和政策；協調全省種子選育、生產、經營和管理各部門的關系，加強會員間的聯系和交流，促進相互協作；為會員提供政策法規、市場信息和科學技術服務，開展業務培訓與技術推廣普及，全面提高我省種業的科技水平和產業化水平，繁榮種子市場；反映會員對種業發展的意見、建議和要求，維護其合法權益；倡導誠實守信，文明經營的行業作風，打造河南種業品牌，推動全省種業持續、穩定、協調、健康發展。
河南省種子協會的業務主管單位是河南省農業廳，掛靠河南省種子管理站，接受中國種子協會、河南省農業廳、河南省科學技術協會和河南省民政廳的業務指導與監督管理。